《东方杂志》创刊于1904年（清光绪三十年），是我馆继《绣像小说》后创办的第二种杂志，也是我馆的标志性刊物。历任主编有孟森、杜亚泉、钱智修、胡愈之、李圣五、郑允恭、苏继庼等。最初为月刊，中途改为半月刊，后复为月刊。创刊时为24开本，后改为16开本。1948年终刊，其间曾因日军侵华造成短暂休刊

《东方杂志》是夏瑞芳提议创办的，名称起初定为《东亚杂志》，但因德国驻上海总领事馆有德文《东亚杂志》，为避同名而改为《东方杂志》。该刊初期为文摘类性质刊物，杂集各家报刊时事新闻、各类消息，辟有社说、谕旨、内务、军事、外交、教育、实业、小说等15个栏目。力求全面、客观、准确地反映国内外政治、经济、文化、教育、军事等诸方面的最新信息，出版不久就受到人们的广泛关注和欢迎。严复、黄遵宪、张謇等著名人士都曾为该刊撰稿，梁启超的《清代学者整理旧学之总成绩》、王国维的《宋元戏曲史》等一些有影响的书稿，也曾在该刊上连载。

《东方杂志》历经清末、辛亥革命、五四运动、抗日战争、解放战争等各个重大历史时期，其间有过几次大的改革。1911年，编译所理化部长杜亚泉兼任杂志主编，对该刊从形式到内容都进行了一次大的改革，把版本改为16开，刊期改为半月刊，每期字数从10万增加到20万，并加大了插图量。内容上，各种思潮兼收并蓄，大量刊登有关最新政治、经济、思想、学术、社会问题的撰述文章和翻译文章，改变了过去文摘类刊物的性质；增设了“科学杂俎”栏目以普及科学知识，增设了“谈屑”栏目以针砭时弊。经他改革，该刊的学术性与可读性大大增强了，销量倍增。“五四”运动后，钱智修继任主编，胡愈之是主要编辑，后来实际上成为主编。胡愈之对该刊也进行了一次大的改革，他采用白话文，使该刊更加接近普通读者。栏目设置也做了调整，增加了时事评论、世界新潮、文苑等，使之成为一个社会科学的综合性杂志。

《东方杂志》断断续续存在了45年。它紧跟时代的脉搏，忠实地记录了我国近现代发展的历史轨迹，成为我国近现代期刊史上影响最大、刊龄最长的综合性杂志。